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Multivariate Analysis and Data Processing

Code: BINF013     Sigla: EDI

Áreas Científicas
Classificação Área Científica
OFICIAL Matemática

Ocorrência: 2020/2021 - 1S

Ativa? Yes
Página Web: https://moodle.ips.pt/2021/course/view.php?id=2227
Unidade Responsável: Matemática e Informática
Curso/CE Responsável: Undergraduate in Bioinformatics

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla Nº de Estudantes Plano de Estudos Anos Curriculares Créditos UCN Créditos ECTS Horas de Contacto Horas Totais
BINF 28 Study Plan 2 - 5,5 67,5 148,5

Docência - Responsabilidades

Docente Responsabilidade
Maria Raquel Feliciano Barreira

Docência - Horas

Theorethical and Practical : 4,00
Type Docente Turmas Horas
Theorethical and Practical Totais 1 4,00
Maria Raquel Feliciano Barreira 4,00

Língua de trabalho

Portuguese

Objetivos





It is intended in this course to convey concepts of probability and statistics so that students know and understand applying advanced statistical techniques for multivariate statistical description, whose purpose is to summarize and describe the most relevant aspects in a data set.
Fundamental notions will be addressed in sampling theory and discrete and continuous probabilistic models. The approach to statistical inference with reference to the hypothesis tests will be explored in more detail.


The theoretical approach will be accompanied by examples related to biology. It is also intended that the knowledge acquired in this curricular unit provides a solid basis for other curricular units in the syllabus.





Resultados de aprendizagem e competências

Not applicable

Modo de trabalho

Presencial

Programa





1. Introduction to R: introduction to the language and data manipulation in R 2. Descriptive Statistics Analysis and graphical presentation, using R;
3. Probabilistic models: discrete and continuous;
4. Regression Analysis;


5. Hypothesis Tests:
5.1 Chi-square test;
5.2 Kolmogorov-Smirnov test and Shapiro-Wilk test; Levene test; 5.3 Parametric tests - independente samples;
(Student t-test e ANOVA test)
5.4 Nonparametric tests - independente samples;
(Wilconxon test; Mann-Whitney test; Kruskal-Wallis test)
5.5 Paired samples test;
6.Multivariate Analysis





Bibliografia Obrigatória

Daniel W. W.; Biostatistics: a Foundation for Analysis in the Health Sciences., Wiley, 2005
Gama, S.; Pedrosa, A.; Introdução Computacional à Probabilidade e Estatística, Porto Editora, 2007
Oliveira, A.; Bioestatística Descodificada, Bioestatística, Epidemiologia e Investigação, Lidel, 2014
Guimarães, R. C.; Cabral, J. A. S.; Estatística., McGraw-Hill, 1999
Wackerly, D. D., Mendenhall, W. & Scheaffer, R. L.; Mathematical Statistics with Applications, Boston: PWS-Kent Publishing Company., 1996

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem





Theoretical-practical classes where, as muc as possible, application examples will be exposed using biological data. Students will have a set of exercises (available from the Moodle ESTBarreiro / IPS) to consolidate learning, some being solved in the classroom and others performed individually with subsequent supervision of the teacher.


In class the software R will be used.

Assessment will be made through continuous assessment (test + work).

Assessment during the exam period will be done through a written exam.





Software

RStudio
R

Tipo de avaliação

Distributed evaluation with final exam

Componentes de Avaliação

Designation Peso (%)
Teste 60,00
Trabalho escrito 40,00
Total: 100,00

Componentes de Ocupação

Designation Tempo (Horas)
Elaboração de projeto 20,00
Estudo autónomo 59,00
Frequência das aulas 67,50
Trabalho escrito 2,00
Total: 148,50

Obtenção de frequência

Not applicable

Fórmula de cálculo da classificação final

Continuous assessment


  • 60%*test+40%*project


 


Final assessment



  • The highest between 60% exam + 40% project and 100% exam

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