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Genómica Estrutural e Evolutiva

Código:

BINF017

Sigla:

GEE

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Biotecnologia

Ocorrência: 2023/2024 - 1S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Departamento de Engenharia Química e Biológica
Curso/CE Responsável:	Licenciatura em Bioinformática

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
BINF	23	Plano Estudos 2016	2	-	5	67,5	135

Língua de trabalho

Português

Objetivos

Esta UC tem como principais objetivos fornecer aos estudantes uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, tendo em conta os métodos de sequenciação, anotação e análise do funcionamento dos mesmos. Para além disso, no final do semestre espera-se que os estudantes conheçam os métodos mais recentes de análise da expressão genética ao nível do RNA e proteínas, para além de compreenderem o funcionamento celular de forma integrada e global. 

Resultados de aprendizagem e competências

Não aplicável

Modo de trabalho

B-learning

Programa

• Estrutura organizacional de um genoma; Métodos de sequenciação de genomas, Anotação e análise de genomas;


• Estrutura primária dos genomas, mecanismos de evolução dos genomas e filogenia molecular;


• Genómica comparativa. Definição de Genes ortólogos e parálogos;


• Análise da expressão genética à escala do genoma: transcritómica e proteómica; Metodologias experimentais para o estudo da regulação da expressão genética;


• Genómica funcional. Metabolómica, RNómica, metagenómica e outras ómicas;


• Aplicações da Bioinformática na genómica. Algoritmos para alinhamento de sequências, inferência filogenética e análise de dados de Next-Generation Sequencing;


• Introdução à Biologia de Sistemas.

 

Bibliografia Obrigatória

Hartl, D. and Bruce Cochrane; Analysis of Genes and Genomes, 2017
Griffiths AJF, Wessler SR et al.; An Introduction to Genetic Analysis, W. H. Freeman, 2015. ISBN: 978-1-4641-0948 (www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK21766/)
Ji Xiong; Essential Bioinformatics, Cambridge University Press, 2006
Barry Hall; Phylogene2c Trees Made Easy: A How-To Manual, Sinauer

Bibliografia Complementar

Jean-Michel Claverie and Cedric Notredame; Bioinformatics For Dummies, Wiley, 2006
Mark Sanders; Gene2c Analysis: An Integrated Approach, Pearson, 2016. ISBN: : 9781292092362

Observações Bibliográficas

Artigos cientificos disponibilizados pela docente

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Esta UC é composta por uma componente teórica e uma componente teórica-prática. A metodologia de ensino na componente teórica baseia-se na exposição oral com projeção de slides em power point, podendo ser complementada por análise de textos científicos; na componente teórica-prática baseia-se na resolução de problemas e realização de tarefas definidas. A plataforma Moodle será usada como repositório de informações, de atividades, ponto de entrega de trabalhos escritos e fórum de discussão.

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Apresentação/discussão de um trabalho científico	30,00
Teste	70,00
Total:	100,00

Componentes de Ocupação

Designação	Tempo (Horas)
Estudo autónomo	75,00
Frequência das aulas	60,00
Total:	135,00

Obtenção de frequência

Teste 1, peso 35 %, sem nota mínima, avaliação no período letivo

Teste 2, peso 35 %, sem nota mínima, avaliação no período letivo

Trabalho 1, peso 30 %, sem nota mínima, avaliação no período letivo

• Para a realização da UC por avaliação contínua é obrigatória a realização de ambos os testes (teste 1 e teste 2) e a realização do Trabalho de grupo.
• O Trabalho de grupo deverá ser composto por min. 2 e max. 4 alunxs; poderá ser atribuída classificação distinta aos alunxs do mesmo grupo com base no domínio do tema e empenho demonstrado na apresentação.
• Não há nota mínima em cada uma das componentes da avaliação contínua
• Para aprovação por avaliação contínua a média ponderada dos dois testes e dos dois trabalhos deverá superior a 9,5 valores
• Em exame, a nota mínima tem de ser igual ou superior a 9,5 valores.

Fórmula de cálculo da classificação final

— Avaliação contínua: +35% Teste 1+35% Teste 2+30% Trabalho 

— 1ª/2ªépoca/época especial: 100% exame