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Laboratório de Bioinformática

Código:

BINF028

Sigla:

LB

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Biotecnologia
OFICIAL	Informática

Ocorrência: 2023/2024 - 1S

Ativa?	Sim
Página Web:	https://stuntspt.gitlab.io/lbinf_23-24
Unidade Responsável:	Departamento de Engenharia Química e Biológica
Curso/CE Responsável:	Licenciatura em Bioinformática

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
BINF	17	Plano Estudos 2016	3	-	10	67,5	270

Língua de trabalho

Português - Suitable for English-speaking students

Objetivos

Esta UC está organizada de modo a que os alunos utilizem os conhecimentos e as capacidades adquiridos em UCs anteriores e desenvolvam seus próprios projetos, em ambiente computacional, com um alto grau de autonomia e apenas com a supervisão necessária. As capacidades de simulação estrutural da UC "Bioquímica Computacional" e de modelação matemática das UCs "Metabolismo e Regulação" e "Modelação de Processos Biológicos" constituem o ponto de partida para esta UC; várias outras UCs das áreas de biotecnologia e informática são também particularmente relevantes.

Resultados de aprendizagem e competências

O objetivo desta UC é levar os alunos a identificar problemas, encontrar e implementar estratégias, realizar as simulações necessárias, analisar os resultados e produzir relatórios, como esperado em ambiente profissional.

Modo de trabalho

Presencial

Pré-requisitos (conhecimentos prévios) e co-requisitos (conhecimentos simultâneos)

Perspetivas em Bioionformática

Programa

1. O método científico e a planificação de projetos – caracterização de problemas, formulação de hipóteses, capacidade de previsão, realização de experiências.
2. Trabalho de projeto – questões relevantes serão analisadas pelos alunos na forma de projetos computacionais de pesquisa de modo semi-autónomo.

Bibliografia Obrigatória

Vince Buffalo; Bioinformatics Data Skills. ISBN: 978-1-4493-6737-4

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

O objetivo desta UC é levar os alunos a desenvolver o seu próprio projeto semi-independentemente utilizando os conhecimentos e as capacidades adquiridos em UCs anteriores. Com isso em mente, uma breve introdução será dada aos alunos sobre organização e desenvolvimento de projetos de investigação científica. Os alunos serão responsáveis por realizar o trabalho por si só, com a necessária supervisão do professor. A parte maior deste trabalho será realizado pelos alunos por conta própria, fora do horário letivo.

Software

VirtualBox
Qualquer distribuição de GNU/Linux

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída sem exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Participação presencial	20,00
Apresentação/discussão de um trabalho científico	20,00
Trabalho escrito	30,00
Trabalho laboratorial	30,00
Total:	100,00

Componentes de Ocupação

Designação	Tempo (Horas)
Apresentação/discussão de um trabalho científico	5,00
Estudo autónomo	45,00
Frequência das aulas	60,00
Trabalho escrito	10,00
Total:	120,00

Obtenção de frequência

Assiduidade obrigatória de um mínimo de 10 aulas para poder ser avaliado.
Realização de 2 trabalhos escritos e do projeto propriamente dito. Apresentação final.

Fórmula de cálculo da classificação final

Avaliação Contínua:

NF = 20% (Contexto de sala de aula) + 10% (Projeto do Trabalho final) + 15% (Relatório final) + 15% (Apresentação) + 40% (Trabalho prático)


UC em regime de exceção - (100% avaliação contínua)

Melhoria de classificação

Melhorias ao projeto/novo projeto