Bioinformatics Laboratory
| Áreas Científicas |
| Classificação |
Área Científica |
| OFICIAL |
Biotecnologia |
| OFICIAL |
Informática |
Ocorrência: 2020/2021 - 1S
Ciclos de Estudo/Cursos
| Sigla |
Nº de Estudantes |
Plano de Estudos |
Anos Curriculares |
Créditos UCN |
Créditos ECTS |
Horas de Contacto |
Horas Totais |
| BINF |
14 |
Study Plan |
3 |
- |
10 |
67,5 |
270 |
Docência - Responsabilidades
Língua de trabalho
Portuguese - Suitable for English-speaking students
Objetivos
This UC is organized so that students use all the knowledge and skills from previous UCs and develop their own projects, in a computational environment, with a high degree of autonomy and under the necessary supervision. The structural simulation skills from “Bioquímica Computacional” UC and the mathematical modelling skills from “Metabolismo e Regulação” and “Modelação de Processos Biológicos” UCs are the key skills the students will develop; various other UCs of the biotechnology and informatics will also be used.
Resultados de aprendizagem e competências
The goal is to have students identifying problems, find strategies, implement them, perform the necessary simulations, analyse the results and produce reports as is expected in a professional environment.
Modo de trabalho
Presencial
Pré-requisitos (conhecimentos prévios) e co-requisitos (conhecimentos simultâneos)
Perspetivas em Bioionformática
Programa
1. The scientific method and planning a project – characterization of the problem, assuming hypotheses, making predictions and performing experiments.
2. Project work – relevant questions will be addressed by students in the form of semi-autonomous computational project works.
Bibliografia Obrigatória
Vince Buffalo; Bioinformatics Data Skills. ISBN: 978-1-4493-6737-4
Métodos de ensino e atividades de aprendizagem
The goal of the UC is to have students develop their own semi-independent project works using the knowledge and skill learnt in previous UCs. With that in mind, a short introduction will be given to students about how to organize an undergraduate research project and how to develop it. Afterwards, students will be responsible for performing the work by themselves, with the necessary supervision from the teacher, provided during classes. The larger portion of this work will be performed by the students, on their own, outside of class time.
Software
VirtualBox
Qualquer distribuição de GNU/Linux
Tipo de avaliação
Distributed evaluation without final exam
Componentes de Avaliação
| Designation |
Peso (%) |
| Participação presencial |
20,00 |
| Apresentação/discussão de um trabalho científico |
20,00 |
| Trabalho escrito |
30,00 |
| Trabalho laboratorial |
30,00 |
| Total: |
100,00 |
Componentes de Ocupação
| Designation |
Tempo (Horas) |
| Apresentação/discussão de um trabalho científico |
5,00 |
| Estudo autónomo |
45,00 |
| Frequência das aulas |
60,00 |
| Trabalho escrito |
10,00 |
| Total: |
120,00 |
Obtenção de frequência
Completion of 2 written assignments and the project itself. Final presentation.
Fórmula de cálculo da classificação final
Classroom context (20%) + Final work project (10%) + Final work report (20%) + Practical work (30%) + Presentation (20%).
No exam.
Melhoria de classificação
Project improvements/new project