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Genómica Estrutural e Evolutiva

Código:

BINF017

Sigla:

GEE

Áreas Científicas
Classificação	Área Científica
OFICIAL	Biotecnologia

Ocorrência: 2019/2020 - 1S

Ativa?	Sim
Unidade Responsável:	Biotecnologia
Curso/CE Responsável:	Licenciatura em Bioinformática

Ciclos de Estudo/Cursos

Sigla	Nº de Estudantes	Plano de Estudos	Anos Curriculares	Créditos UCN	Créditos ECTS	Horas de Contacto	Horas Totais
BINF	13	Plano Estudos 2016	2	-	5	67,5	135

Língua de trabalho

Português

Objetivos

Esta UC tem como principais objetivos fornecer aos estudantes uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, tendo em conta os métodos de sequenciação, anotação e análise do funcionamento dos mesmos. Para além disso, no final do semestre espera-se que os estudantes conheçam os métodos mais recentes de análise da expressão genética ao nível do RNA e proteínas, para além de compreenderem o funcionamento celular de forma integrada e global.

Resultados de aprendizagem e competências

não aplicável

Modo de trabalho

Presencial

Programa

• Estrutura organizacional de um genoma;  Métodos de sequenciação de genomas, Anotação e análise de genomas.


• Estrutura primária dos genomas, mecanismos de evolução dos genomas e filogenia molecular.


• Genómica comparativa. Definição de Genes ortólogos e parálogos.


• Análise da expressão genética à escala do genoma: transcritómica e proteómica de expressão. Metodologias experimentais para o estudo da regulação da expressão genética.


• Genómica funcional. Quimiogenómica, metabolómica, RNómica, metagenómica e outras ómicas.


• Aplicações da Bioinformática na genómica. Algoritmos para alinhamento de sequências: alinhamentos simples e múltiplos; algoritmos de pesquisa de motivos: representação de motivos e sistemas de pesquisa disponíveis na web


• Introdução à Biologia de Sistemas.

Bibliografia Obrigatória

Hartl, D. and Bruce Cochrane; Analysis of Genes and Genomes, 2017
Griffiths AJF, Wessler SR et al.; An Introduction to Genetic Analysis, W. H. Freeman, 2015. ISBN: ISBN: 978-1-4641-0948
Ji Xiong; Essential Bioinformatics, Cambridge University Press, 2006
Barry Hall; Phylogeneic Trees Made Easy: A How-To Manual, Sinauer

Bibliografia Complementar

Jean-Michel Claverie and Cedric Notredame; Bioinformatics For Dummies, Wiley, 2006
Mark Sanders; Genetic Analysis: An Integrated Approach, Pearson. ISBN: 9781292092362

Métodos de ensino e atividades de aprendizagem

Esta UC é composta por uma componente teórica e uma componente teórica-prática. A metodologia de ensino na componente teórica baseia-se na exposição oral com projeção de slides em power point, podendo ser complementada por análise de textos científicos; na componente teórica-prática baseia-se na resolução de problemas e realização de tarefas definidas. A plataforma Moodle será usada como repositório de informações, de atividades, ponto de entrega de trabalhos escritos e fórum de discussão.

Tipo de avaliação

Avaliação distribuída com exame final

Componentes de Avaliação

Designação	Peso (%)
Apresentação/discussão de um trabalho científico	30,00
Teste	70,00
Total:	100,00

Componentes de Ocupação

Designação	Tempo (Horas)
Estudo autónomo	75,00
Frequência das aulas	60,00
Total:	135,00

Obtenção de frequência

- Os testes tem nota mínima de 8 valores para acesso à avaliação contínua;

- A média ponderada dos testes e trabalho deverá superior a 9,5 valores aprovação por avaliação contínua.

- Em exame, a nota mínima tem de ser igual ou superior a 9,5 valores.

- O Trabalho é um relatório de um projeto realizado em grupo e com apresentação oral; poderá ser atribuída classificação distinta aos alunos do mesmo grupo com base no domínio do tema e empenhamento demonstrado.

- É obrigatória a entrega do Trabalho para acesso à avaliação contínua.

Fórmula de cálculo da classificação final

— Avaliação contínua: +35% Teste 1+35% Teste 2+30% Trabalho

— 1ª/2ªépoca/época especial: 100% exame