Com vista à obtenção de ganhos de eficiência na gestão dos recursos, bem como a melhoria do cumprimento das estratégias de evolução, a organização da ESTBarreiro/IPS baseia-se em Secções aprovadas pelo Diretor, mas com parecer positivo do Conselho Técnico-Científico.
Cada Secção agrega uma ou várias Áreas Científicas tendo por finalidade essencial a realização de atividades de ensino, de investigação e desenvolvimento, de prestação de serviços ao exterior e de gestão dos meios humanos e materiais a ela afetos, em consonância com os Órgãos da ESTBarreiro/IPS.
A cada Área Científica está associada uma área de conhecimento estruturante da Escola, correspondendo-lhe um conjunto de unidades curriculares.