BINF001 - ECTS

BINF002 - ECTS

BINF035 - ECTS No final da unidade curricular pretende-se que os estudantes tenham a capacidade de: a) Compreender os princípios da classificação e da diversidade de organismos vivos. b)Detalhar aspetos estruturais e funcionais de biologia celular. c) Distinguir os princípios básicos do metabolismo das células vegetais e animais. d) Compreender os fundamentos do controlo da divisão celular e os fundamentos da hereditariedade f) Saber realizar técnicas para observação em microscopia ótica e de espectrofotometria g) Saber realizar técnicas de coloração, nomeadamente coloração GRAM h) Saber identificar aspetos da Biodiversidade a nível local, regional e nacional i) Saber distinguir elementos de diversidade associada aos diferentes reinos taxonómicos

BINF005 - ECTS

Esta UC tem como principais objetivos oferecer ao estudante uma visão global da boinformática, como uma ciência interdisciplinar que permite o armazenamento e a análise de grandes volumes de informação biológica, envolvendo bioquímicos, biólogos, matemáticos e especialistas nas técnicas de informação mais recentes aplicadas às ciências Biológicas e Químicas. Para além disso, pretende-se com esta UC, apresentar ao estudante vários campos de ação e aplicação da bioinformática.

BINF031 - ECTS A UC “Programação Aplicada à Bioinformática” tem como objetivo a compreensão da noção de algoritmia como a formalização da solução para um problema bem determinado numa sequência de ações elementares. No final, o estudante deverá ser capaz de: analisar um algoritmo fornecido e prever o resultado final da sua execução; desenhar algoritmos em linguagem natural e pseudo-código. Compreender e conhecer: a programação de computadores como um modo de descrever algoritmos numa linguagem formal passível de ser executada num computador de uso geral; princípios elementares da programação: variáveis; instruções de decisão; instruções de ciclo; listas e arrays; o ciclo tradicional de desenvolvimento de programas de computador: desenho, programação e teste. Aplicar os conhecimentos desses princípios básicos a uma linguagem de programação apropriada. Ser capaz de traduzir um algoritmo dado num programa completo. Ser capaz de resolver um problema dado efetuando o seu desenho, programação e teste.

BINF006 - ECTS Pretende-se que o estudante se familiarize com os fundamentos gerais da Química, com vista à compreensão da estrutura da matéria e das suas transformações, bem como os conceitos fundamentais da análise química quantitativa, nomeadamente, saber distinguir entre os vários equilíbrios químicos. Compreender os equilíbrios ácido-base de modo a poder utilizar soluções tampão e realizar titulações e volumetrias de ácido-base. Entender os complexos e respetivos equilíbrios de modo a poder realizar titulações. Reconhecer os equilíbrios de solubilidade e o efeito do ião comum. Perceber as reações redox e respetivas titulações. Apesar do carácter essencialmente introdutório desta UC, pretende-se que os estudantes adquiram competências que lhes permitam uma melhor adaptação e compreensão dos processos químicos envolvidos em UCs subsequentes, fundamentais para o acesso ao mercado de trabalho.

BINF007 - ECTS

BINF008 - ECTS

O estudante deverá ser capaz de projetar, conceber e implementar bases de dados utilizando o modelo relacional de bases de dados. São apresentados os conceitos, os vários modelos e os sistemas de bases de dados existentes. Pretende-se que adquira a capacidade de descrever a arquitetura de um Sistema de Gestão de Bases de Dados e e utilizar uma ferramenta de construção de bases de dados com esta abordagem. Deverá neste âmbito compreender o funcionamento transacional, os mecanismos de concorrencia, segurança e tolerância a falhas e autorização/autenticação num SGBD.

É também objetivo que o estudante adquira competências na análise e extração de informação da base de dados. Serão apresentadas as linguagens de definição de dados e de manipulação de dados.

Para a componente prática, de entre as ferramentas disponíveis, será utilizada uma base de dados de arquitetura cliente/servidor de referência no mercado.

BINF009 - ECTS Esta unidade curricular tem por objectivo o aprofundar dos conhecimentos sobre a unidade básica functional dos seres vivos – a célula, em termos da sua composição, dinâmica e funcionamento.

BINF004 - ECTS

Objetivos de aprendizagem (conhecimentos, aptidões e competências a desenvolver pelos estudantes):

• Aquisição de conhecimentos teóricos e práticos fundamentais à compreensão dos SI e do seu papel nas organizações, de modo particular na área da saúde;
• Aquisição de conhecimentos nucleares em domínios associados aos SI (Gestão da Informação, Arquitetura, Gestão de Projetos, Auditoria, Ética);
• Capacidade de identificação de soluções para problemas concretos no quadro dos SI a partir da leitura organizacional;
• Identificar de alguns dos principais métodos, ferramentas e soluções no âmbito dos SI;
• Identificação da importância das atividades de conceção, gestão e controlo dos SI em contexto organizacional;
• Capacidade de reflexão crítica sobre questões relativas aos fundamentos dos SI;
• Enquadramento da função e papel do Gestor de Sistemas de Informação.

BINF010 - ECTS O aluno dever ser capaz de aplicar as medidas descritivas apropriadas aos dados em estudo; proceder a uma amostragem correcta e identificar as restrições e os limites da representatividade de uma amostra; fazer uma análise descritiva univariada e bivariada; identificar distribuições de probabilidades e saber calcular probabilidades mediante a distribuição em causa; diferenciar e saber utilizar a estimação pontual e a estimação por intervalos de confiança; saber formular hipóteses de investigação e proceder à sua análise a partir de testes de hipóteses.

BINF012 - ECTS

Pretende-se que o estudante se familiarize com fórmulas, estruturas, nomenclatura e conceitos básicos no domínio da Química Orgânica. Reconheça a importância, numa dada molécula, do papel e distribuição dos eletrões que podem intervir nas reações orgânicas. Classifiquem as reações dos compostos orgânicos.

Compreendam as reações químicas e justifiquem através do mecanismo os fatos ocorridos. Apliquem o conhecimento da reatividade dos diferentes grupos funcionais com vista à obtenção de novos compostos, isto é projetem os conhecimentos adquiridos na síntese orgânica.

Adquiram o conceito de geometria das moléculas no espaço associado ao estudo da estereoquímica.

BINF013 - ECTS

BINF014 - ECTS O objetivo desta UC é o conhecimento e compreensão da estrutura e das propriedades das principais classes de biomoléculas (glícidos, lípidos, proteínas e ácidos nucleicos), das interações destas com o solvente água, e do modo como elas reagem controladamente no contexto da célula viva.

BINF015 - ECTS

Nesta unidade curricular o estudante deverá ser capaz de caracterizar a arquitetura e distinguir os diferentes modelos de um Data Warehouse, abordando o modelo dimensional de Ralph Kimball e o modelo enpresarial de W. H. Inmon.

Pretende-se que o estudante domine as componentes do Data Warehouse, e que consiga planear e executar o ciclo de desenvolvimento de um Data Warehouse. Deverá conseguir dominar a análise e desenho do processo ETL e ter conhecimento de ferramentas de interrogação OLAP.

Deverá desenvolver competências práticas no desenvolvimento de data warehouses com base no esquema em estrela e capacidade para construir expressões MDX, utilizando as ferramentas de Data Tools do Microsoft SQL Server ou então na solução Oracle Exadata Intelligent Warehouse.

BINF016 - ECTS Esta UC irá expandir alguns dos temas introduzidos na UC "Química Geral". A ligação química e as forças intermoleculares serão exploradas como uma extensão das propriedades dos átomos. Uma introdução à termodinâmica está também incluída. As espectroscopias de absorção serão apresentadas em estreita relação com as características estruturais por elas elucidadas; a espectrometria de massa e a ressonância magnética nuclear serão mostradas como ferramentas analíticas estruturais.

BINF017 - ECTS

Esta UC tem como principais objetivos fornecer aos estudantes uma visão integrada da estrutura e funcionamento dos genomas, tendo em conta os métodos de sequenciação, anotação e análise do funcionamento dos mesmos. Para além disso, no final do semestre espera-se que os estudantes conheçam os métodos mais recentes de análise da expressão genética ao nível do RNA e proteínas, para além de compreenderem o funcionamento celular de forma integrada e global. 

BINF032 - ECTS Esta UC tem como principais objetivos oferecer ao estudante uma visão global do paradigma da programação orientada a objetos. No fim da unidade curricular o estudante deverá ser capaz de: - Identificar e aplicar os fundamentos do paradigma da Programação Orientada a Objetos (POO). - Analisar problemas e desenhar soluções para esses problemas utilizando o paradigma orientadas a objetos - Construir aplicações de software comuns utilizando uma linguagem de programação orientada a objetos. - Desenhar e implementar soluções através do trabalho em equipa.

BINF019 - ECTS O objetivo desta UC é introduzir os princípios fundamentais da análise de sequências biológicas, partindo do conceito de sequência (DNA, RNA e proteínas), associada à estrutura das biomoléculas, para promovera compreensão das aplicações dos vários algoritmos e para proporcionar a capacidade de escolher os algoritmos mais adequados e interpretar os resultados obtidos. Serão estudados os métodos mais frequentes, devendo os alunos ser capazes de os perceber e os transcrever para código, e serão analisadas as várias ferramentas disponíveis de análise e tratamento de sequências de modo a que os alunos as dominem adequadamente.

BINF020 - ECTS

BINF033 - ECTS

Bioética
(OA.1) Compreender a abordagem bioética e a relevância da relação ciência, ética e sociedade.
(OA.2) Enquadrar as questões de âmbito biotecnológico numa abordagem ética.
(OA.3) Discutir casos e temáticas, aplicando adequadamente o pensamento da bioética, teorias predominantes e modelos argumentativos à avaliação das situações concretas
Segurança da Informação
(OA.4) Identificar os principais riscos e ameaças do Ciberespaço e a necessidade de a Segurança da Informação encontrar respostas estruturadas para as mesmas.
(OA.5) Compreender e saber aplicar os principais conceitos subjacentes à Segurança da Informação, as suas limitações e inter-relação.
(OA.6) Compreender e os principais conceitos ligados ao risco dos ativos de informação das organizações e desenvolver capacidades de análise materializadas através de diversos elementos, tais como estratégias, arquiteturas, políticas, normas e procedimentos, etc.

BINF022 - ECTS

• Conhecer os conceitos associados ao Business Intelligence, nomeadamente DataWarehouse, ETL e Reporting Tools e, a infraestrutura tecnológica de suporte;
• Entender a importância do Business Analytics como prática de exploração iterativas de dados, permitindo a tomada de decisão.
• Compreender a importância do Data Mining nas organizações
• Descobrir conhecimento em Bases de Dados através da aplicação de técnicas de Data Mining;
• Compreender os principais conceitos, metodologias e técnicas de Data Mining.

BINF027 - ECTS

. Adquirir um conhecimento concetual, profundo e especializado sobre Empreendedorismo.

.    Compreender de forma crítica as teorias e os princípios sobre Empreendedorismo.

.    Conceber soluções criativas e inovar quer num contexto de criação de novas empresas, quer em empresas já existentes.

.    Resolver problemas complexos e imprevisíveis relacionados com ambientes empresariais.

.    Aplicar ferramentas de planeamento estratégico para a criação e desenvolvimento de novos negócios.

.    Desenvolver planos de negócio para a criação de empresas.

.    Assumir responsabilidades pelo desenvolvimento individual e coletivo enquanto empreendedor por conta própria ou por conta de outrem.

.    Desenvolver autonomia no que concerne à tomada de decisões e resolução de problemas num contexto de criação da própria empresa ou de empresas já existentes de forma proactiva, inovadora gerando valor sustentável.

BINF024 - ECTS

BINF025 - ECTS

BINF026 - ECTS A UC "Bioquímica Computacional" visa desenvolver as capacidades de modelação em química e bioquímica, incluindo a modelação de proteínas e da sua interacção com outras moléculas. Os estudantes irão estudar a validade e aplicabilidade dos métodos de dinâmica molecular a problemas envolvendo biomoléculas – proteínas, ácidos nucleicos e membranas.

Usando o conteúdo desta UC os estudantes serão capazes de:
- Escolher as técnicas adequadas para modelar os vários problemas relativos à estrutura;
- Planear e executar os cálculos necessários;
- Utilizar as ferramentas existentes de análise de resultados ou escrever os seus próprios códigos de análise utilizando os conhecimentos de programação adquiridos em outras UCs.

Os estudantes desenvolverão as capacidades fundamentais de modelação de estruturas, com aulas práticas focadas em levá-los a trabalhar de forma crescentemente independente.

BINF028 - ECTS

Esta UC está organizada de modo a que os alunos utilizem os conhecimentos e as capacidades adquiridos em UCs anteriores e desenvolvam seus próprios projetos, em ambiente computacional, com um alto grau de autonomia e apenas com a supervisão necessária. As capacidades de simulação estrutural da UC "Bioquímica Computacional" e de modelação matemática das UCs "Metabolismo e Regulação" e "Modelação de Processos Biológicos" constituem o ponto de partida para esta UC; várias outras UCs das áreas de biotecnologia e informática são também particularmente relevantes.

BINF029 - ECTS O objetivo desta UC é fornecer conhecimentos sobre modelação matemática necessários para simular sistemas biológicos/bioquímicos de um ponto de vista cinético e metabólico. Esta formulação matemática advém da biologia
dos sistemas, em que os sistemas podem ser modelados através da utilização de equações diferenciais que englobam não só a cinética e os fluxos do sistema mas também os aspetos de regulação e compartimentação. Esta UC inclui também modelos de aplicação farmacocinética, que foram inicialmente introduzidos na UC “Metabolismo
e Regulação”. Nesta UC, os estudantes desenvolvem competências em análise bio-matemática de sistemas biológicos utilizando ferramentas computacionais e bases de dado na área da biologia de sistemas.

BINF034 - ECTS

O Curso de Bioinformática é um curso que resulta da conjugação de esforços de 4 escolas do IPS. Assim, faz

sentido que no plano curricular exista uma UC de carater multidisciplinar e agregadora de diferentes saberes. Esta

UC, com 5 ECTS, surge no 5º semestre do curso com uma componente TP e maioritariamente OT, é

operacionalizada através de um sistema de tutorias que acompanha e apoia o percurso do estudante.

O objetivo geral é permitir ao estudante construir um percurso de aprendizagens específico, garantindo o

reconhecimento de aprendizagens e de competências adquiridas em diversos contextos e situações - de natureza

científica, académica, profissional e social - desde que reconhecidas como significativas, relevantes e pertinentes

no âmbito das competências desejáveis para os licenciados do curso. Estas atividades podem ser desenvolvidas

ao longo de todo o curso (estágios extracurriculares, projetos de investigação ou outros, etc) ou serem

estruturadas somente neste 5º semestre.

BINF030 - ECTS O principal objetivo desta UC é conseguir que o estudante resolva um novo problema, correspondendo a uma nova situação em contexto de trabalho, num estágio ou sob a forma de um projeto, com base nas capacidades e conhecimentos adquiridos durante a licenciatura em Bioinformática.